Coğrafiya İnstitutunun nəzdində Elmi Şura fəaliyyət göstərir.
Direktorun əmri ilə yaradılmış və AMEA Yer Elmləri Bölməsi tərəfindən təsdiq edilmiş Elmi Şurada İnstitutun daxili həyatına aid olan məsələlər müzakirə edilir və qərarlar qəbul edilir. Elmi Şurada elmi-tədqiqat işlərinin prioritet istiqamətləri müəyyən edilir, mövzular və işlər təsdiq edilir, başa çatmış elmi-tədqiqat işləri müzakirə və qəbul edilir. Elmi Şurada başa çatmış işlər içərisindən ən mühüm nəticələr müəyyənləşdirilir, Yer Elmləri Bölməsinə və AMEA Rəyasət Heyətinə təqdim edilir. Burada çöl elmi-tədqiqat işlərinin planları da müzakirə və qəbul edilir.
ELMİ ŞURANIN TƏRKİBİ:
| Sıra nömrəsi | Soyadı, adı və atasının adı | Elmi dərəcəsi, vəzifəsi |
| 1 | Eminov Zakir Namin oğlu | Sədr – c.e.d., baş direktor |
| 2 | Həmidova Zərnurə Ənvər qızı | Katib – c.ü.f.d., elmi katib |
| 3 | Rzayeva Solmaz İsaq qızı | c.ü.f.d, şöbə müdiri |
| 4 | Əliyev Əmir Soltan oğlu | c.e.d., şöbə müdiri |
| 5 | Əliyev Ənvər Abbas oğlu | a.ü.f.d, şöbə müdiri |
| 6 | Haqverdiyev Habil Tağı oğlu | c.ü.f.d, şöbə müdiri |
| 7 | İmrani Zaur Tahir oğlu | c.ü.f.d, şöbə müdiri |
| 8 | İsmaylov Mirnuh Cavad oğlu | c.ü.f.d, şöbə müdiri |
| 9 | Qardaşov Rauf Hacı oğlu | AMEA-nın müx.üz., f.r.e.d., şöbə müdiri |
| 10 | Quliyev İsmayıl Əhliman oğlu | a.ü.f.d, şöbə müdiri |
| 11 | Mahmudov Rza Nadir o | c.e.d., şöbə müdiri |
| 12 | Paşayev Nəriman Əziz oğlu | c.e.d, şöbə müdiri |
| 13 | Rəhimov Xəyyam Şakir oğlu | c.ü.f.d, şöbə müdiri |
| 14 | Səfərov Səid Həsən oğlu | c.e.d., şöbə müdiri |
| 15 | Tağıyeva Yelena Nikolayevna | c.e.d., şöbə müdiri |
| 16 | Yunusov Müseyib İdris oğlu | c.ü.f.d, şöbə müdiri |